20 листопада 2012 року в КПБА була проведена вже друга Всеукраїнська наукова конференція "ПРАВОСЛАВ"Я В УКРАЇНІ". Розпочав пленарне засідання ректор КПБА, архієпископ Єпіфаній (Думенко). У вітальному слові Владика-ректор наголосив на необхідності нового неспотвореного переосмислення власної історії в цілому, та церковної історії зокрема. Також владика наголосив на тому, що як і минулоріч оргкомітет конференції здійснив видачу науоквого збірника (з опублікуванням статей учасників конференції) ще до початку самої конфенціії та поінформував присутніх, що всі учасники конференції (які прибули до Києва на пленарне засідання) вже отримали цей збірник.

Згодом до присутніх у залі зі словами вітань звернулися митропролит Львівський і Сокальський Димирій (Рудюк), архієпископ Чернігівський і Ніжинський Євстратій (Зоря) та запрошені гості.

Продовжила конференція свою роботу у вигляді заслуховування доповідей.

Із завершальним словом на пленарному засіданні виступив Святійший Патріарх Київський і всієї Руси-України Філарет.

Вже стало традиційним для такого роду наукових заходів, що по завершенні пленарного засідання учаники продовжили свою роботу на секційних засіданнях . Не стала виключенням і цьогорічна конференція.

Завідувач Богословського відділеня доц. прот. Микола Щербань прийняв участь у роботі секції присвяченої проблемам церковної історії та мистецтва, де виступив із доповіддю "Вилучення церквовних цінностей і питаня збереження історико-культурних цінностей у контексті антирелігійної боротьби в Україні у 20-х роках ХХ століття: історіософський аспект". На секційному засіданні відбулася жвава дискусія щодо запропованих до обговорення питань.